生物多样性是生物和它们组成的系统的总体多样性和变异性，包括物种内、物种之间和生态系统的多样性和变异性。生物物种是否丰富，生态系统类型是否齐全，遗传物质的野生亲缘种类多少，将直接影响到人类的生存、繁衍、发展。在全球范围内生物多样性正受到威胁，生物多样性保护刻不容缓。
我市地域广阔，气候适宜，生物资源丰富。为保护生物多样性，我市相继建立县级以上自然保护区7个，其中省级自然保护区2个（洪泽湖东部湿地和涟水涟漪湖黄嘴白鹭自然保护区）。建立县级以上森林公园6个，其中国家级森林公园2个（铁山寺和第一山），省级森林公园1个（洪泽湖古堰）。据了解，全市现有高等植物1500多种，其中木本植物234种，隶属34科146属，其中属国家重点保护植物的有11种。野生动物有鸟类321种，经济鱼类83种，爬行动物48种，哺乳动物49种，其中属国家一级保护动物9种、二级保护动物43种。洪泽湖的水生和湿地生物资源有水生高等植物81种、鱼类67种、底栖动物76种、鸟类194种，其中属国家一类重点保护的有4种、二类重点保护的有26种。（市生态办 刘玉山）